Proteolytické enzýmy účinkujú aj proti bolesti. Neutralizujú zápalové mediátory, ako sú kiníny a prostaglandíny, ktoré inak priamo vyvolávajú bolesti na nervových receptoroch.

Druhý mechanizmus je štiepením plazmatických bielkovín a imunokomplexov – podporujú fagocytózu, zmenšujú opuch a uľavujú od bolesti z tlaku.